日本警视厅特殊部队（SIT）小队长濑文焚流（加濑亮饰），在一次执行任务时遭遇队友的离奇死亡，面对高层他百口莫辩，最终被调职到公安部公安第五课——不明事件调查科。该部门专门调查一些匪夷所思的超自然案件，

受野立信次郎（竹野内丰 饰）之托从国外回来的大泽绘里子（天海佑希 饰）成为警视厅搜查一课的特别犯罪对策组的boss，但编派到她手下的组员却形态各异，来自科学搜查研究所调来的嗜睡如命的木元真实（户田惠梨

受野立信次郎（竹野内丰饰）之托从国外回来的大泽绘里子（天海佑希饰）成为警视厅搜查一课的特别犯罪对策组的boss，但编派到她手下的组员却形态各异，来自科学搜查研究所调来的嗜睡如命的木元真实（户田惠梨香饰），从交通组调来的外冷内热刑警片桐，从派出所调来的活力小子花形一平，以及总是偷懒的来自反黑组的严井和人称“丢三落四先生”的山村巡查部长。这样一班乌合之众放在一起，着实让大泽头痛，搜查一课对她的部门从没寄予厚望，只需要她应对媒体公关。但大泽却不愿成为被人摆布的木偶，面对这样一班下属与不断发生的案件，她将以身作则

桔孝平即将退休，他和妻子千寻约好以此为契机结束婚姻。孝平是著名建设公司的骨干，他准备离职后进入年轻情人夏美开的建设事务所当合伙人。千寻当年遵循父命结了婚，三十年来一直专心打理家务，对丈夫言听计从。在孝平退休那天，千寻准备了一桌菜肴，女儿真纪也带着男朋友来庆贺，而孝平却和往常一样没有回家吃饭。正彦和光江经营着一家卖鱼铺，夫妻两人虽然经常斗嘴，但感情很好。正彦患上了糖尿病。遵从医生静夫的嘱咐，光江小心控制丈夫的饮食，并拉着他每天晚上去散步。正彦年轻时曾经组过乐队，他在乐器店的橱窗里看到一把保罗•麦卡特尼用过的

经过与一十一（神木隆之介 饰）的恶战，濑文焚流（加濑亮 饰）身受重伤，命几不保。在此期间，青池里子（栗山千明 饰）随女儿小润（森山树 饰）悄然离开医院；而各国政要的一次关于简单计划的秘密会议上，自称卑弥呼的日本代表抹杀所有人，他代表SPEC持有者正式向普通人类宣战。世态险恶的当下，濑文急急出院，和当麻纱绫（户田惠梨香 饰）一同调查青池母女的行踪。而野野村组长（龙雷太 饰）则独自行动，查找简单计划病毒疫苗的下落。新的SPEC持有者交替登场，残酷的杀戮却从未停止。关于前人类的秘密昭然若揭，惨烈浩大的人种战争即

前人类和普通人类的人种战争已经到了白热化的阶段，野野村组长去世后，吉川（北村一辉 饰）、当麻纱绫（户田惠梨香 饰）和濑文焚流（加濑亮 饰）等人聚在未详总部，苦苦思索J教授的真身。谁知就在当麻刚刚弄清真相的同时，警察医院内的成年和儿童SPEC持有者遭到残忍屠戮。愤怒的当麻无法抑制体内被封印的SPEC，她狂乱暴走，继而现身御前会议。在犹大、世界（向井理 饰）、润（大岛优子 饰）的见证下，法蒂玛第三预言实现了。恐怖刺眼的蘑菇云在上空升起，成千上万的八尺乌遮天蔽日，被欲望所支配与荼毒的世界迎来了毁灭时刻。 　　在

蓝泽的祖母绢江因急性肺炎被送到了在急救医疗中心工作的蓝泽等人处。只能让母亲紧急入院又不能陪同祖母的蓝泽倍感自责。之后，在事故中被摩托车撞伤的主妇和孩子陷入危急情况，紧急派遣了直升机。孩子心肺停止，虽然努力尝试心肺复苏，但孩子留下后遗症的可能性很大，明知这点还是施术了的蓝泽，为自己的选择是否正确而感到难过。白石因为自己造成了恩师黑田右臂被切断的原因，无法与这个过去告白而感到烦恼。另一边，也由于和自己著名的心脏内科医生父亲之间的父女代沟而苦恼。