本季故事围绕中国自然景观与传统文化展开。小纵队帮助红嘴相思鸟重返家园，探索茶文化；在徽州古村落学习歙砚工艺，并参与元宵节鱼灯制作，展现了中华文化的魅力与自然保护的和谐共生。

海底小纵队是一群活跃在海底的小小探险家，集结了巴克队长（北极熊）、皮医生（企鹅）、生物学家谢灵通（海獭）、摄像师达西西（腊肠狗）、机械工程师突突兔（兔子）、小队中尉呱唧（小猫）和章教授（章鱼）7名伙伴

有一天，冲绳附近的海域出现了一种奇怪的生物。 “它”的外形类似于棘冠海星，它的毒液会伤害渔民，并迅速蔓延到整个日本。这是怪物达嘎拉 (Dagahra) 复活的预兆，达嘎拉是由传说中的古代文明 Nira

以巴克队长为领导核心，小队集结了医生、生物学家、摄像师、机械工程师等7名伙伴。他们是一群活跃在海底的小小冒险家，有着各自的爱好与独一无二的特长，在团队核心巴克队长的带领下向着未知的海域不断探索前进。精

未来某日，中国海军截获关键情报——一艘超级潜艇正密谋一项针对我国东南沿海城市的绝密军事计划。我方派出最新型潜艇“龙鲸号”，与蛟龙小队协同作战。海底战场险象环生，蛟龙遭遇重重陷阱，潜艇与敌多番埋伏周旋，

该片以海洋作为故事上演的舞台，融合了动作、探险、海洋生物科学课程以及学龄前团队协作等内容。动画讲述了八个可爱小动物组成的海底探险小队的故事。

以巴克队长为领导核心，小队集结了医生、生物学家、摄像师、机械工程师等7名伙伴。他们是一群活跃在海底的小小冒险家，在团队核心巴克队长的带领下向着未知的海域不断探索前进。

2015年10月21日，英国银色之门媒体公司宣布将与中国中央电视台联合开发全球知名儿童海洋探险动画《海底小纵队》第五季。签字仪式于当天下午在英国文化部举行。中国中央电视台副总编辑李挺作为代表与英国银色

在队长巴克的带领下，生活在章鱼堡总部基地中，大家的使命就是探险、拯救、保护；只要地球上的小动物遇到了困难、危险，需要帮助的时候，海底小纵队的队员们会团结一心，帮助动物们。队员们依靠先进的舰艇、飞机、道具等一次次化险为夷。

《海底小纵队第六季》是以海洋作为故事上演的舞台，动画主要讲述了八个可爱小动物组成的海底探险小队的故事。本季小纵队的成员们再次准备出发去解决海底及陆地的险情、排除潜在可能发生的危险。 海底小纵队以巴克队长为领导核心，集结了呱唧、皮医生、达西西、章教授、谢灵通、突突兔、小萝卜等团队成员，他们为小动物提供帮助与救援，完成海底小纵队“探险、拯救、保护”的使命。 海底小纵队第六季每一集动画都建立在一次探险的基础之上，小队成员发挥自己的特殊本领，克服险境，探索海洋奥妙，发现未知生物。