张正（周润发 饰）这名美籍华人被任命到中国大陆护送一件宝物运到美国。随后他来到了著名的少林寺等待消息。随和的他马上跟少林寺里一名七岁的小和尚清淳结下友谊之情。毕竟凡夫俗子与出家人的生活习惯存在很大

隋朝末年，隋将王世充的侄子王仁则在督建河防工事时，杀死了起来反抗暴虐的神腿张，但令其儿子小虎子跳河逃离虎口。小虎子被少林僧人救起收入寺中后，为报父仇毅然削发为僧，法名“觉远”。王仁则的侍卫长遇见牧羊女白无瑕后垂涎其美色，强行将其抢回府并欲酒后施暴，恰巧被只身前来报仇的觉远发现。在救白无瑕逃生的过程中，觉远因武功欠佳被王仁则刺伤，促使其回到少林寺后更加刻苦练功。后因觉远救援被王仁则追赶的李世民，少林寺遭遇劫难，觉远身上的责任更重一层。

明朝中叶，皇帝年幼继位，太监王其自封“立皇帝”权倾朝野，与倭寇勾结，妄图篡位，大明江山岌岌可危。忠良之后徐子豪是京都总兵徐超之子，也是皇帝的伴读。徐子豪贪玩，无意间撞到太监王其送“秘密计划”给倭寇的武林高手。徐子豪把这件事告诉了父亲徐超。朝堂之上，徐超向皇帝弹劾王其，反被王其陷害，徐家满门抄斩。徐子豪进入少林寺避难。

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故事发生在清朝年间，皇帝病重，需要用小活佛体内的舍利子方能医治。得知此事的五王爷找到了少林寺方丈，命他交出小活佛，方丈不从，五王爷出兵血洗了少林寺。受方丈所托，欣宜（李若彤饰）带着福仔（胡斌饰）、神通

嵩山少林寺，自達摩祖師一苇渡江，開山授藝，创立少林派後，千餘年來，一直領袖着天下武林。及至淸乾隆年間，少林寺不幸爲淸廷鹰爪所控，假和尙智空，左道旁門，招收入一批俗家女弟子，修練走火入魔的「銅女功」，號

童灯的父亲张铁头死于福王的霹雳旋风腿之下，童灯和表妹小翠由童灯的舅舅白玉峰抚养。白玉峰为迎接李自成而将童灯托付给少林寺的广慈师傅。在少林寺中，小福王假传圣旨命令僧兵远征，童灯等小沙弥请求广慈暗授武艺以

明末，农民起义风起云涌，关外满族又蠢蠢欲动，世间生灵涂炭，明朝守将关志远被叛徒出卖，被敌人里应外合，边关失守，致使全军覆没。危难之际，唯一的儿子关少龙被少林寺的高僧救起。关少龙身负国仇家恨，在少林寺苦练武功，十年之后，当他学成期满时，按照少林寺的规矩，只有经过少林寺十八铜人巷的考验才可以下山。经过艰苦奋战，少龙终于如愿以偿。而这时他也知道父亲当年是被一奸细出卖，而这奸细如今已经是高官而且武功奇高，凭借勇气和不服输的劲头，经过一场血战，终于手刃仇人，报了血海深仇。

九王爷（白彪饰）谋朝篡位，带领奸臣叛贼，杀入皇宫；皇帝（艾飞饰）见大势已去，于是命两个忠心侍卫各抱一太子 杀出重围，保留其皇室一族的龙脉。展转间，大太子（狄龙饰）由少林戒律院三位高僧抚养长大，法号首行，并习得一身 少林功夫；二太子（尔冬升饰）则易名五子泰，由丞相（谷峰饰）抚养。五子泰往少林寺借阅...《少林传人》便是唐佳出任导演後执导的第一部作品，剧本由王晶撰写，影片邀得叁大武侠片巨星狄龙、尔冬升及白彪加盟。唐佳与刘家良一样，都是邵氏旗下的金牌武术指导，他尤其擅长兵器打斗方面的设计，如《天涯、明月、刀》

李世民因屡立战功，被父王册封，统管兵权，遭到了太子妒忌，太子设计使李世民被郑国大将王仁则追杀，幸被村里行侠仗义的张宝拳和他的儿子小宝搭救，将他藏匿于山中。